Los fondos onchain de un nodo LN están menos seguros que los fondos onchain de una wallet fría, eso es así, los fondos están online todo el tiempo.

Ahora si los fondos están en canales, están seguros ya que están en una tx multifirma, a menos de que tomen control de tu nodo y cierren canales y muevan los fondos.

Ante ello lo mejor es tener el nodo seguro, no instales nada más que no tenga que ver con LN y/o Bitcoin, una buena password para acceder, procura acceder vía SSH y no accedas desde cualquier sitio, de preferencia desde tú red interna o a través de Tor.