**科学新闻:中国科学家给出的基因组信息有助于澄清COVID19的起源**
最近,中国疾病控制中心的研究团体发表了有华南海鲜市场的研究报告。这份报告引起了国际学术界的关注。相关的国际学者对该团队发表的基因组数据进行了进一步的研究,也发表了几篇论文。美国著名的《科学》对这些研究进行了新闻综述,发表在2023年3月29日的科学新闻栏目中:
Chinese researchers release genomic data that could help clarify origin of COVID-19 pandemic (https://www.science.org/content/article/chinese-researchers-release-genomic-data-help-clarify-origin-covid-19-pandemic)
本人借助Chatpad把该新闻翻译成中文,供各位参考。依据国人的阅读习惯,本人调整了一些表达方式。本人也把该报道中的出现的参考文献,用注释的方式加入。
面对科学界巨大呼声,中国的研究人员今天发布了大量新的基因数据,这些数据可能提供新的线索,揭示 COVID-19 疫情的起源。他们还大幅修订了13个月前首次发布的相关研究。中国团队的这个研究提供了支持野生动物是 SARS-CoV-2中间宿主这个假设的证据:SARS-CoV-2 可能是从貉獝或其他哺乳动物跳跃到人类的。
这个研究报告包含了来自的华南海鲜市场环境的数据,即2020年初收集于华南海鲜市场内或附近的923个样本。这个中国团队最初的预印本认为,从这些样本中发现的基因序列,“高度暗示”人类将冠状病毒带到了那里,没有提到表明易感哺乳动物存在的证据。他们更新后的预印本承认了动物的基因证据,并且现在表示收集的样本不能解决感染动物、人类或甚至是受污染的食品是否将病毒引入市场。
“我很高兴数据已经更新并在不同平台上提供,研究人员已经在一个预印本服务器上发布了他们的更新手稿,”上周,世界卫生组织(WHO)的流行病学家玛丽亚·范·科克霍夫(Maria Van Kerkhove)敦促这个中国团队分享市场数据之后表示。“我再次强调,与 SARS-CoV-2 起源有关的所有数据都需要立即提供。”
这篇预印本的作者主要来自中国疾病预防控制中心(CCDC),主要关注于他们在2020年1月至3月期间在HNHX市场取样的“环境样本”,这些样本来自排水口、容器、桌子、门、地面等。在2020年12月COVID-19病例开始在市场出现后,该市场于2020年1月1日被迅速关闭。最初,包括预印本的合著者高福在内的CCDC研究人员表示,他们怀疑市场上的动物引发了疫情。但他们后来否认该市场销售非法哺乳动物,并表示是进口鱼类或来自其他国家的人将病毒带到了那里。
这篇CCDC的预印本于2022年2月发布在Research Square\[1\] (https://assets.researchsquare.com/files/rs-1370392/v1_covered.pdf?c=1645813311)上,该平台上的论文正在接受《自然》杂志系列的期刊审稿。这篇论文没有讨论市场上发现的野生动物序列,并得出结论:“无法推断出任何SARS-CoV-2的动物宿主。” 在中国以外,另一个问题困扰着人们:病毒是否是由一名感染者带到市场的,而这名感染者在病毒从相对较近的武汉病毒研究所泄漏出来后感染了病毒。该研究所一直致力于研究在蝙蝠中发现的冠状病毒。
现在,高福和他的合作者们已经将更多的数据发布在包括GISAID在内的数据库中,许多研究人员使用这些数据库来分享SARS-CoV-2的遗传序列。在他们修订后的预印本中,他们在3月29日发布在ChinaXiv服务器\[2\] (https://chinaxiv.org/abs/202303.10351)上,指出“环境样本显示了不同脊椎动物属的丰富度。”其中一些样本也有SARS-CoV-2的痕迹。然而,“这些环境样本不能证明动物的感染,”高福、刘威廉、吴桂珍和他们的合作者们警告说。
“此外,即使动物被感染,考虑到采样时间至少是在市场内人际传播发生一个月后,仍不能排除人对动物的传播”。因此,他们得出结论:“人类或冷链产品可能会将病毒引入市场的可能性仍未被排除。”
新加坡国立大学的系统生物学家Greg Tucker-Kellogg认为,感染的动物引发了这一大流行病。 他表示,修订后的预印本清楚地表明,坚称该市场不出售野生动物的中国当局“从来没有说实话”,并且“我们所知道的没有任何追踪这些野生动物来源的充分努力”。 即使有了这个更新,他补充说,“仍然有许多必要的数据我们现在还没有。”
武汉市场的基因序列进入公众视线的方式很不寻常。法国国家科研机构CNRS的进化生物学家Florence Débarre三周前在GISAID上浏览数据时惊讶地发现了其中的一个子集。当她与其他的科学家团队合作分析这…