Rodar seu próprio node te dá autonomia. Você vira um participante da rede ativamente e começa a fazer parte do consenso.

Os nodes públicos ficam analisando a blockchain, atribuindo IPs a endereços de carteitas.

Qualquer governo hoje em dia pode rodar um node pra saber quantos satoshis você tem.

Então rodar seu próprio node te dá maior privacidade, principalmente se você está na rede Tor.

Dá pra começar comprando um Raspiberry e um SSD externo. Ai você instala o MyNode nele e já era.