問題のリポストは Damus で行ったものなので、もしも、複数の e タグがよろしくないのだとすると、それは Damus のバグになるんだと思います。

kind 6 に e タグが複数あることで、クライアントによって、 mention 側をリポストしたと解釈するものと root側をリポストしたと解釈するものみたいな感じで、リポストされたとするノートの解釈が異なってしまった形なのかな?