是这样的，唐朝因为安史之乱丧失西域以后，伊斯兰势力在10世纪开始大量扩张进入西域，并且扩张性极强，摧毁了西域其他原生宗教。那时候的中国是北宋时期，积贫积弱，河西走廊被西夏挡住，根本接触不到西域。

到了南宋时期，西域反而被辽国收复了。辽国也是讲汉语的国家。

后来蒙古人灭了西辽建立了察合台汗国。这个汗国一开始是信蒙传佛教的，但是后来改信伊斯兰教了。到了明朝时期，整个西域基本上都信伊斯兰教了。明朝也没有占领它，而作为朝贡国。

到了清朝，准噶尔蒙古人占领了西域，这个蒙古族是信佛教的。清朝和准噶尔爆发了百年战争，最终将准噶尔这个民族九族全部诛灭。并正式占领西域，改名新疆。当地因为蒙古族被杀光再次失去了制衡，伊斯兰教又占据多数了。

1884年，清末汉族军阀左宗棠出兵再次夺回新疆并正式建省，自此新疆一直在汉族军阀的统治下再也没有独立过。