もう一度総務省のページを見てください。

総務省｜ふるさと納税のしくみ｜税金の控除について https://www.soumu.go.jp/main_sosiki/jichi_zeisei/czaisei/czaisei_seido/furusato/mechanism/deduction.html?advisorReferral3=cpa-navi_adv-seminar

①所得税からの控除 = （ふるさと納税額－2,000円）×「所得税の税率」

とあります。これが基本になります。所得税の税率をかけてるでしょ？私になにか勘違いがありますか？