Não é uma versão diferente dos fatos, isso seria a definição de mentira.
São os fatos. A inquisição produziu uma vasta quantidade de documentos pois o tribunal registrava praticamente tudo.
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Estão disponíveis online?
A maioria está em bibliotecas e universidades européias. No Archivo Histórico Nacional da Espanha, no Arquivo Nacional da Torre do Tombo em Portugal, no Arquivo Apostólico do Vaticano, este último acessível apenas por acadêmicos, Universidade de Notre Dame, etc.
Digitais eu realmente não sei dizer quantos tem. Seria necessário procurar a fundo. Pesquise no site da Universidade de Notre Dame e no Portal de Archivos Españoles.